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Deuxième année
Les cours proposés dans cette deuxième année préparent les étudiants à poursuivre des recherches en bioinformatique et modélisation sur des sujets concernant l'évolution des séquences (ADN, ARN et protéiques), l'expression génique, la biologie structurale et la génétique des populations.
La liste suivante contient les programmes des nouvelles UE proposées pour l'enseignement en M2 BIM ainsi que les cours qui pourront être choisis dans les masters de mathématiques ou biologie (dans les masters BMC et BIP). La cohérence dans les choix de chaque étudiant sera contrôlée par l'équipe pedagogique.
Nous avons deux vagues de cours au premier semestre, appelées V3 et V4. Chaque cours correspond à 3 ECTS. Les cours durent 7 semaines, certains débutent mi-septembre (V3) et d'autres dèbuteront fin novembre (V4) pour se terminer fin janvier. Sur les deux vagues, les étudiants devront suivre 30 ECTS de cours.
Au deuxième semestre, les étudiants suivront 12 ECTS de cours (vague V5) et à partir du début avril, ils devront effectuer un stage de recherche de 6 mois auprès d'un laboratoire, qui donnera lieu à un rapport écrit et à une soutenance de stage. Ceci correspondra à 18 ECTS.
Pour chaque semestre, les UE en orange sont obligatoires. L'étudiant pourra aussi choisir des UE d'autres specialités, par exemple, parmi celles en blanc ou vert ou jaune dans le tableau ci-dessous.
Avant le début des cours
Une semaine avant le début des cours de M1, un cours de mise à niveau de 12h sera offert. Ce cours n'est pas obligatoire mais est fortement conseillé.
| Acronyme | Nom | Responsable | Durée | Spec. |
| INTRO | Introduction à la biologie moléculaire | M. Boccara | 12h | BIM |
Semestre 3 (M2S3)
Semestre 4 (M2S4)
| Acronyme | Nom | Responsable | ECTS | Spec. |
| MINEPLEX | Fouille de données complexes : génomique, transcriptomique et clinique | J-D. Zucker & C.Henegar | 3 | BIM |
| ARN | Modélisation et bioinformatique de l'ARN | M.Boccara & H.Isambert & Y.Ponty | 3 | BIM |
| SR | Stage recherche | A.Carbone | 18 | BIM |
| MGDE | Modèles graphiques pour la décision | C. Gonzales | 3 | IAD |
| RHAD | Recherche heuristique et algorithmes pour la décision | P. Perny | 3 | IAD |
| SMA | Systèmes multi-agents | A. El Fallah Seghrouchni | 3 | IAD |
| NM448 | Modélisation des rythmes du vivant | A.Golbeter & J-P.Francoise | 3/6 | math |

